К сравнительно анатомическим доказательствам эволюции стоит отнести:

1) сродство в строении клеток видов различных царств, что гипотетически доказывает существование общего предка.

2) схема строения тела позвоночных — при помощи палеонтологических методов исследования ученым удалось обнаружить, как постепенно усложнялся скелет всех позвоночных, а также другие система их организмов.

3) наличие гомологических органов у разных видов анатомически близких организмов;

4) наличие рудиментарных органов у некоторых видов, которые характерны для некоторых других представителей более крупных таксономических единиц, к которым они принадлежат;

5) наличие у некоторых видов атавизмов, например, появление у некоторых людей нехарактерной для современных представителей человечества многососковости или чрезмерно развитого волосяного покрова;

6) Установленное наличие аналогичных органов при отсутствии родства между видами, например, жабры рака и рыбы. Это доказывает влияние среды обитания на формирование тех или иных признаков.

7) Наличие органов у разных видов, которые имеют незначительные различия в строении и выполняют схожие функции (например, задние конечности у птиц, человека, макак и т.д.).

8) Схожий план строения некоторых органов и систем органов у более широких таксонов, нежели отдельный вид.

9) Наличие индивидуальных и иногда довольно существенных различий при аутопсии представителей одного вида, но разных популяций.