Пищеварительная система начинается ротовой полостью у всех перечисленных моллюсков (брюхоногих, двустворчатых, головоногих). Если головоногие – активные хищники, то двухстворчатым свойственна пассивность в вопросе добычи пищи. Разница также в том, что происходит с пищей. В глотке брюхоногих есть специфическое образование - хитиновую тёрку (радула), которая измельчает пищу и переходит в пищевод. У головоногих пища перемалывается роговой челюстью и переходит в глотку, где слюна переваривает полисахариды, протеиновые компоненты. У представителей двустворчатых отсутствуют глотка, радула, а с ними и слюнные железы. В желудки этих моллюсков открываются печёночные протоки, а в желудок головоногих ещё и поджелудочные ферменты. От желудка идёт кишечник. У представителей головоногих и брюхоногих кишка коротка и заканчивается отверстием (брюхоногие) или анальным отверстием (головоногие). А вот у двустворчатых кишка поднимается к спине, затем проходит через околосердечную сумку с желудочком и завершается клоакальным сифоном