Вирусы подразделяют на штаммы в зависимости от большого количества параметров:

по почве;

по воде;

по воздуху;

по времени года;

по чувствительности организма живого существа, будь то человек, птица или животное.

Так, например, из-за этого нередко говорят о водных штаммах, весенних, птичьих и т. д. Вирусы, находясь во внешней среде, постоянно оказываются под воздействием тех или иных факторов:

ультрафиолетового излучения;

солнечной радиации;

химических веществ и т. д.

Это естественным образом приводит к мутациям микроорганизма, переводя на более научный язык — изменениям в структуре нуклеиновой кислоты патогена. От того, какой вариант мутации случился, зависит то, как вирусы меняют свой свойства, например способность менять хозяина. По такой схеме, например, произошла ситуация, когда вирус, поражающий лишь птиц, вдруг стал опасным и для человека. Именно по типу нуклеиновой кислоты, которая и определяет наследственные признаки у вирусов, его легко исследовать. Также изучение штамма могут проводить по предпочтениям питательной среды и продуктам жизнедеятельности, выделяемым им в жизненном цикле. Кроме того, для изучения используются формы колоний, образуемые вирусами и уровень ферментообразования.

Каждый исследованный штамм получает собственное имя. После того как оно озвучено посредством публикации, его начинают использовать во всем мире.