Проект Туруханской ГЭС вызывает критику со стороны различных экологических организаций. Согласно их мнению, вероятны следующие неблагоприятные последствия сооружения ГЭС:засоление водохранилища и нижнего течения Енисея в результате выхода подземных рассолов,радиационное загрязнение в результате разгерметизации полостей подземных ядерных взрывов,переработка берегов водохранилища и активизация оползневых процессов,протаивание многолетней мерзлоты и спуск водохранилища,усиление парникового эффекта вследствие разложения затопленной в водохранилище растительности и почвенного покрова, ухудшение качества воды в водохранилище и Енисее,неблагоприятные изменения местного климата,нарушение природных путей миграции северных оленей и их массовая гибель,потеря охотничьих угодий,ухудшение условий существования коренного населения — эвенков, потеря их национальной идентичности,затопление больших объёмов леса — залесенная площадь 806,3 тыс. га, запас древесины 53 млн м³,непредсказуемое влияние на сейсмические процессы