В годы правления Годунова были сделаны важные шаги на пути становления крепостничества в России. В 1597 г. вышел указ об урочных летах, предусматривавший пятилетний срок сыска и насильного возвращения беглых. Был также обнародован указ, лишавший холопов права освобождения путем уплаты долга по старым договорам. И правительство Ивана Грозного, и правительство Бориса Годунова предпринимали шаги по прикреплению крестьян к земле, стремясь предотвратить запустение земель.
Большое внимание уделял Годунов строительству новых городов. При нем шло активное освоение Поволжья, появились города Саратов, Самара, Царицын, Томск и др. Население Сибири значительно выросло. Крупным успехом Годунова было учреждение в России патриаршества. Удалось улучшить и международное положение страны. Борис Годунов стремился укрепить внутреннее положение государства, пытался освоить обширные территории на юге и востоке страны.