К началу XIX века в Приенисейском крае назрела необходимость серьезных изменений: постепенно сокращалась торговая и снижалась экономическая роль северных территорий, всё больше населения проживало в южных районах. В 1822 году по предложению генерал-губернатора Сибири графа Михаила Сперанского была впервые выделена самостоятельная Енисейская губерния с центром в Красноярске. Из старых уездов были выделены Канский, Минусинский, Ачинский и Енисейский округа, во главе которых стояли окружные начальники. В том же году был принят «Указ об управлении инородцами Сибири», который был призван пресечь произвол властей над местным коренным населением.

За счёт естественного прироста и переселенцев численность русского населения продолжала увеличиваться, росли города и крупные деревни, появлялись новые сёла и заимки. Всё более широкое распространение получили различные промыслы, такие как пчеловодство, добыча извести, мыловарение, изготовление масла, свечей и многие другие. Продолжала развиваться торговля — на территории губернии работало 17 крупных ярмарок. В этот же период в губернии начинается настоящая «золотая лихорадка», появляется значительное число золотопромышленников, таких как Гадаловы, Кузнецовы и другие.

Важную роль в жизни молодой губернии играли ссыльные, среди которых было немало образованных людей, сделавших много для развития просвещения и науки. После восстания декабристов в 1825 году в губернию был сослан 31 участник декабристского движения, среди них Михаил Фонвизин, Павел Бобрищев-Пушкин, Василий Давыдов, Михаил Митьков и многие другие. Декабристы открывали школы для простых ребятишек, занимались медициной, юридическими консультациями, развивали сельское хозяйство, были владельцами крупных библиотечных собраний.

Постепенно менялся внешний облик городов губернии. Каменные церкви и здания появляются в Канске, Ачинске, Минусинске и, конечно, Красноярске. Особенно масштабное строительство развернулось в столице губернии: центр города застраивался великолепными особняками купеческой знати. В 1855 году на деньги купца Петра Кузнецова была построена известная часовня Параскевы Пятницы, являющаяся символом Красноярска. В губернском городе был парк для гуляний, зал общественного собрания, а в 1838 году была открыта публичная библиотека.