Последующие 30 лет Винниченко провёл в Европе, преимущественно во Франции, куда он перебрался в 1925 году. Первоначально жил в Париже, а с 1933 года — в городке Мужен близ Канн, в небольшой усадьбе, где продолжал внимательно следить за событиями в СССР, занимался сельским хозяйством, литературным творчеством и живописью. Разработал собственную мировоззренческую концепцию «конкордизма».

Во время Второй мировой войны за отказ сотрудничать с нацистами был заключён в концентрационный лагерь, серьёзно подорвавший его здоровье. После окончания войны призвал к всеобщему разоружению и мирному сосуществованию народов мира. В романе «Слово за тобой, Сталин!» (1950) обратился к председателю Совета министров СССР с предложениями демократизации в Советском Союзе (разделы 22 и 23 романа).

Умер 6 марта 1951 года. Похоронен на кладбище городка Мужен (департамент Приморские Альпы, Франция).