Организован в 1941 на базе гастролировавшего в Иркутске Горьковского театра музыкальной комедии. Основатель и первый директор - актер Л.Сагайдачный. Во время Великой Отечественной войны с театром сотрудничали артисты Киевского академического театра оперы и балета. В 1950-80-е годы в репертуаре преобладала классическая и советская оперетта, ставились произведения местных композиторов, в том числе оперетта "Желтый дьявол", балеты "Даурия" и "Кошкин дом", музыкальные сказки "Аленький цветочек", "Сказки золотого багульника" А.Кулешова. В 1990 театр получил статус музыкального и новое здание, открывшееся 5 января того же года оперой "Кармен" Ж.Бизе. Впоследствии были поставлены оперы Дж.Верди, Р.Леонкавалло, Г.Доницетти, С.Рахманинова, А.Даргомыжского, балеты А.Адана, П.Чайковского и др. С середины 90-х годов благодаря сотрудничеству с "Театром пилигримов" ставятся рок-оперы. В 1997 открыта Камерная сцена. За последние годы гастролировал во Владивостоке, Ярославле, Воронеже, Киеве.