Калиновка, небольшое село, каёмкой золотистых изб окружала неподвижное озеро.
Уточняющее слово- небольшое село.

Земля, давно не видевшая дождя, трескалась на открытых местах.
Обособленный причастный оборот- давно не видевшая(какая?) дождя.

Скрипя всем корпусом, вагоны шли в гору по высокой насыпи.
Обособл. дееприч. оборот- скрипя(что делая?) всем корпусом.

Эта речка вёрст за пять от Льгова превращается в широкий пруд, заросший густым тростником.
Обособл. прич. оборот- заросший(какой?) густым тростником.

Кроме утомительных пробежек, Сергей разрешил нам играть в футбол.
Уточняющее слово- кроме утомительных пробежек.

Тайком забираясь в кабинет отца, он читал все книги, попадавшиеся ему под руку.
Обособл. дееприч. оборот- тайком забираясь(что делая?) в кабинет отца. Обособл. прич. оборот- попадавшиеся(какие?) ему под руку.

На склоне небольшого пригорка, у самой дороги, одиноко стояла молоденькая берёзка.
Уточняющее слово- у самой дороги.

Февраль, холодный и вьюжный, отсчитывал последние дни, и уже начинало пахнуть весенним теплом.
Обособл. однородные определения- холодный; вьюжный. Перед союзом И ставится запятая, т.к. это сложное предложение: февраль отсчитывал; начинало пахнуть.

Несмотря на свои дружелюбные слова, он впился в доктора беспокойным пронизывающим взором.
Обособл. наречие- несмотря(наречие) на свои дружелюбные слова.

Сев на ветку, сойка кладёт сброшенный ветром жёлудь под лапку и, взмахнув головкой, ударяет клювом по жёлудю.
Обособл. дееприч. обороты- сев(что сделав?) на ветку; взмахнув(что сделав?) головкой.