Родился Базаров в семье полкового лекаря Василия Базарова и дворянки Арины Власьевны, выучился в университете на доктора (пойдя по стопам отца) . В университете Базаров познакомился и подружился с Аркадием Николаевичем Кирсановым. Вскоре они вместе поехали в имение Кирсановых. Там Базаров познакомился с отцом Аркадия Николаем Петровичем и дядей Павлом Петровичем. Конфликтовал с Павлом Петровичем из-за отличий во взгляде на жизнь. 

Затем Базаров знакомится с Анной Одинцовой и влюбляется в неё. Любовь к ней коренным образом меняет выраженность нигилизма у Евгения — он «уверовал» в любовь. После этого Базаров едет к своим старым родителям, побыв у них с неделю, едет вновь к Кирсановым, где заигрывает с Фенечкой и стреляется на дуэли с Павлом Петровичем Кирсановым. 

Базаров едет к отцу, где начинает лечить всех, кто нуждается в помощи врача. В итоге он заражается тифом и умирает. Перед смертью Базаров видится с Анной Одинцовой.